gapFinisher : A reliable gap filling pipeline for SSPACE-LongRead scaffolder output

vastutusandmed
Juhana I. Kammonen, Olli-Pekka Smolander, Lars Paulin, Pedro A. B. Pereira, Pia Laine, Patrik Koskinen, Jukka Jernvall, Petri Auvinen
allikas
kirjastus/väljaandja
ajakirja aastakäik number kuu
vol. 14, 9
ilmumisaasta
leheküljed
art. e0216885, 21 p. : ill
võtmesõna
sequence alignment
bacterial genomics
sequence assembly tools
mammals
BLAST algorithm
genomics statistics
genomic libraries
computational pipelines
ISSN
1932-6203
märkused
Bibliogr.: 36 ref
Open Access
Open Access
teaduspublikatsioon
teaduspublikatsioon
klassifikaator
1.1
kategooria (üld)
kvartiil
Q1
TTÜ struktuuriüksus
keel
inglise
Uurimisrühm
Kammonen, J. I., Smolander, O.-P., Paulin, L. et al. gapFinisher : A reliable gap filling pipeline for SSPACE-LongRead scaffolder output // PLoS ONE (2019) vol. 14, 9, art. e0216885, 21 p. : ill. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0216885