Bioinformaatika

TalTech prioriteetne teadussuund
Uurimisrühma juht
Uurimisrühma liige
Võtmesõna
arvutusbioloogia
genoomika
transkriptoomika
üksikrakk
sekveneerimine
Ülevaade
Uurimisrühm keskendub oma teadustöös mitmetasandilise andmestiku, näiteks genoomilise info, genoomilise variatsiooni, transkriptoomika, geeniregulatsiooni võrgustike ning erinevate sekveneerimisandmestike integreerimisele eesmärgiga lahendada kompleksseid bioloogilisiprobleeme. Peamine fookus on koondunud taimegenoomikale, mikroobide genoomikale ja nende kooslustele ning vähigenoomikale.Rühm on pädev analüüsima ja integreerima kõiki praegusi omika andmete modaalsusi ja asjakohast bioloogilist teavet. Rühm on võimeline läbi viima ka üksikrakuanalüüse ja loob praegu võimalusi teostada pika lugemisega sekveneerimist.2022. aastal sai uurimisrühm TeChBioT konsortsiumi osana ka märkimisväärse rahastuse (ca 360 000 EUR) Euroopa Kaitsefondist ning juhib konsortsiumis TalTechi meeskonda.TeChBioT konsortsiumi osana töötab rühm uudsete lahenduste pakkumisega bioloogiliste ja keemiliste ohtude tuvastamiseks, identsifiseerimiseks ja jälgimiseks. Koostöös TalTechi Microfluidicsuurimisrühmaga arendab rühm ka tööriistu, mis võimaldavad laiemale teadusringkonnale kasutada ja analüüsida dropplet-põhiseid mõõtmisandmeid.
Tähtsamad tulemused
2023. a tulemused: on leitud, et protsessid, mis reguleerivad taimekasvuhormooni tsütokiniini, muudavad nii puidu moodustumise kiirust, st puude paksenemist, kui ka koostist, st puidu omadusi, mida toodetakse selles protsessis. See arusaam võimaldab teadlastel katsetada geneetilisi modifikatsioone, mis võimaldavad kiiremat puidu tootmist või kontrolli toodetud puidu omaduste üle, mis pakub huvi näiteks süsiniku sidumisel ja biorafineerimistehaste lähteaine tootmisel. On koostatud kõige põhjalikum andmestik geenide aktiivsuse kohta, mida see kasvuhormoon mõjutab puidu moodustumise ajal arenevas puidus paksenemise ajal.
Uurimisrühma tegevusperiood
Seotud struktuuriüksus
Teadusgrupiga seotud publikatsioonid